Au cœur de la Bohême, douce région de plateaux, Prague s'étend sur les rives de la Vltava, la plus longue rivière de la République tchèque. A Melnik, à 30 km en aval, la Vltava rejoint l'Elbe (Labe en tchèque), qui traverse l'Allemagne pour se jeter dans la mer du Nord.
Le climat est de type continental humide, caractérisé par des étés chauds et pluvieux, des hivers froids et neigeux et une météorologie généralement instable. De juin à août, la température peut varier de 12 à 22°C. De décembre à février, les températures descendent fréquemment en dessous de zéro. Les mois les plus secs (janvier à mars) restent néanmoins pluvieux (un jour sur trois), tandis que les longues périodes d'ensoleillement estival sont souvent perturbées par des orages soudains et violents. Les mois les plus agréables sont mai et septembre.
Si l'air pragois est généralement respirable, les inversions thermiques hivernales rendent l'atmosphère particulièrement malsaine, les gaz d'échappement et les fumées polluantes n'arrivant plus alors à se disperser.
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