Malaysian Airlines et Pelangi Air, l'autre compagnie nationale, offrent de nombreux vols intérieurs. En Malaisie orientale, où les déplacements se font généralement en avion, les vols locaux sont souvent tributaires des conditions climatiques. Le réseau de bus est étendu, fiable, économique et très bien organisé. Les trains se limitent à deux lignes : l'une va de Singapour à Kuala Lumpur et Butterworth, puis continue jusqu'en Thaïlande. Elle bifurque à Gemas, point de départ de la deuxième ligne qui dessert Kuala Lipis et remonte jusqu'au nord-est du pays, tout près de Kota Bharu. Une fois admises les règles de la circulation à gauche, conduire en Malaisie ne pose aucun problème ; les routes sont en bon état et l'essence peu onéreuse. Des bateaux relient la péninsule aux îles au large du continent et circulent sur les rivières du Sarawak et du Sabah. Au niveau local, taxis et bus sont fort répandus. Kuala Lumpur dispose d'un bon réseau de trains de banlieue et d'une ligne de métro.
Kuala Lumpur est la plaque tournante des vols internationaux à l'arrivée ou au départ de Malaisie. Subang, son aéroport, se situe à 20 km à l'ouest du centre-ville. Plusieurs compagnies internationales desservent la Malaisie, mais Malaysia Airlines System (MAS), la compagnie nationale, détient l'essentiel du trafic international. Penang, Kota Kinabalu, Malacca et l'île de Tioman possèdent également des aéroports internationaux, mais le trafic se limite aux autres pays d'Asie, notamment la Thaïlande, Singapour et l'Indonésie. On peut entrer en Malaisie par la route et en train depuis la Thaïlande (à l'Est et à l'Ouest) ou Singapour (au Sud). Vous pouvez passer de Malaisie en Indonésie par voie terrestre au Sarawak et par voie maritime au Sabah. Des bateaux relient la Malaisie à la Thaïlande, à Singapour et à l'Indonésie (Sumatra).
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