Djerba se caractérise par une grande aridité. Comme dans tout le sud de la Tunisie, le problème le plus crucial du pays est l'eau - et plus précisément la pénurie d'eau. D'où une végétation rare et clairsemée sur l'ensemble de la presqu'île. Seuls quelques champs d'oliviers noirs et quelques frêles palmiers rompent avec la monotonie du paysage. Notons également l'existence de l'oasis de Cedghiane, où le creusement d'un puit artésien a permis la culture de palmiers, de citronniers et de pamplemoussiers.

Côté faune, la Tunisie a vu disparaître de très nombreuses espèces, comme les éléphants, les lions, les cheetahs, les lynx, les gazelles... On essaie actuellement de réintroduire certaines espèces comme les mouflons et les antilopes. A Djerba comme ailleurs, parmi les animaux encore en grand nombre, citons les mangoustes, les chacals, les hyènes, les fennecs, les reptiles et, naturellement, les dromadaires. Djerba est également une étape pour certains oiseaux migrateurs, comme les flamants roses qui se rassemblent, en hiver, sur la péninsule de Ras Remel.