L'Indonésie possède de nombreuses compagnies aériennes, une flotte d'appareils hétéroclites et un réseau étendu de lignes permettant d'accéder facilement aux régions les plus excentrées. Ne jamais oublier de confirmer un vol. Garuda, la compagnie nationale, propose le Visit Indonesia Decade Pass, billet valable dans tout le pays mais à acheter à l'étranger.
Le réseau ferroviaire se limite à une liaison est-ouest sur l'île de Java et à la traversée de quelques régions de Sumatra.
Les bus sont le principal moyen de transport indonésien ; ils vont des modèles " ekonomi ", vieux tacots déglingués qui assurent les liaisons interurbaines (en embarquant passagers, courrier, chèvres, cochons...) aux cars de luxe, en passant par les bus express (patas) et les bus de nuit (bis malam).
Les minibus (bemo), camionnettes à trois roues dotées d'une rangée de sièges de chaque côté, desservent les zones les plus excentrées. Ils portent toutes sortes de noms : becak (rickshaws à trois roues), bajaj, dokar (carrioles à deux roues, agrémentées de clochettes !), andong ou delman, grandes charrettes pour six personnes.
Si vous préférez la voiture, sachez que, en gros, le code de la route est inexistant et que l'étranger sera toujours responsable en cas d'accident. Avis aux amateurs !
Les motocyclistes devront quant à eux (du moins sur les grands axes) affronter d'autres types d'embûches : routes défoncées, chauffeurs fous, boufs nonchalants, enfants imprudents, chiens et poulets vagabonds, voitures non éclairées la nuit.
Pour voyager d'île en île, de nombreux ferries relient régulièrement toutes les îles depuis Sumatra jusqu'à Timor en passant par Java, Bali et Nusa Tenggara.
Les principales portes d'entrée aériennes sont Jakarta et Bali (Denpasar). Singapour propose les vols les moins chers, ce qui implique cependant de changer d'avion à Singapour ou de gagner l'Indonésie en bateau - même chose pour Penang, en Malaisie. Les voyages négociés par les agences sont souvent plus intéressants.
Par voie terrestre, la seule liaison s'effectue par Entikong, à l'est de la Malaisie.
La plupart des liaisons maritimes se font entre la Malaisie et Sumatra (Penang-Medan, Port Kelang-Medan, Melaka-Dumai), mais de plus en plus de voyageurs empruntent le ferry rapide entre Singapour et l'archipel de Riau, à Sumatra.
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