Les lignes intérieures sont desservies par les compagnies aériennes LAB, TAM et AeroXpress. Attendez-vous à des retards, à des annulations inopinées et, d'une façon générale, à un manque de fiabilité. Le réseau routier bolivien laisse à désirer avec sa pénurie de chaussées goudronnées. La route de La Paz aux Yungas est officiellement considerée comme laplsu dangereuse du monde. La plupart des bus longue distance roulent de nuit. Pour profiter du paysage, mieux vaut alors monter dans un camion, le mode de transport que privilégient les paysans locaux. Vous dépenserez ainsi deux fois moins qu'en bus mais dans des conditions de confort plutôt précaires. Il existe deux réseaux ferroviaires, l'un à l'ouest du pays, l'autre à l'est. Si le premier est franchement chaotique, le second n'en souffre pas moins d'une désorganisation chronique. En dehors des ferrobus, tous les trains se révèlent d'une lenteur exaspérante. Les rivières Ichilo, Mamoré, Beni, Madre de Díos et Guaporé constituent les principales voies de communication du bassin de l'Amazone.
Seul un nombre limité de compagnies aériennes proposent des liaisons directes avec la Bolivie, et ce à des tarifs élevés. Beaucoup de voyageurs préfèrent prendre l'avion à destination d'un pays voisin comme l'Argentine, le Brésil, la Colombie ou le Pérou et franchir la frontière par voie terrestre. Cette formule se révèle souvent plus économique.
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