En l'absence de bus, les principaux moyens de transport en commun restent les minibus et les taxis-brousse 504 Peugeot. Les prix des taxis sont très raisonnables : le trajet de Cotonou à Abomey, soit 144 km, coûte environ 4,5 €. Les minibus reviennent au quart du prix, mais mettent plus longtemps. Il existe à Cotonou quatre grandes gares routières d'où partent les taxis-brousse. Mais de nombreux voyageurs conseillent plutôt de les héler quand ils sortent de la ville. A la station, ils attendent d'être pleins pour partir.
Des trains relient Cotonou à Parakou via Bohicon (près d'Abomey). Ils partent dans l'un et l'autre sens, tous les matins. Il existe aussi un train de nuit avec wagon-lit un jour sur deux. Le trajet complet dure environ 9 heures.
On peut louer des voitures à l'aéroport de Cotonou ou au Sheraton. Au tarif kilométrique s'ajoute un tarif journalier. Pour un voyage de 200 km par jour, il faut compter environ 118 €, plus l'essence.
Une seule compagnie, TRANS-AIR BENIN, assure les liaisons aériennes Cotonou / Watitingou et Cotonou / Paralzou.
Il existe des vols directs pour le Bénin depuis la France, la Belgique et de nombreux pays africains. On peut aussi atterrir à Lomé au Togo et, de là, prendre un taxi pour rejoindre Cotonou en 3 heures.
Aller en taxi du Niger à Cotonou se révèle facile, mais demande du temps (environ 14 heures). La frontière est ouverte de 7h à 19h30. Depuis le Nigeria, le trajet ne dure que 3 heures. Vous pouvez aussi conduire vous-même car les grandes routes des principaux pays limitrophes sont goudronnées et en bon état.
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